在各种因素的作用下，病毒、细菌、辐射或化学物质会破坏父母一方或双方的染色体结构，而父母的染色体畸变会影响胎儿的正常发育，导致畸形和其他不良情况。几乎有无数的因素可以导致胎儿畸形，包括母亲在怀孕期间所患的各种疾病、服用的各种药物以及接触的各种有毒物质。虽然在大多数情况下，不可能确定导致畸形的具体因素，但第三代试管婴儿技术的出现，可以帮助这类患者避免这些因素，生出健康的宝宝。
如果孕妇在备孕期间和怀孕的关键阶段经常接触到某种因素，这种因素可能是导致胎儿畸形的具体原因。一般来说，从备孕到怀孕前3个月是胎儿发育的关键阶段，在怀孕前6个月结束时，胎儿还很小，但其身体各部分的发育基本完成。
例如，在一个家庭中，如果夫妻双方年龄过大或一方甚至双方都有染色体异常，妻子生下的孩子就容易出现早期流产、胎儿流产、先天性畸形等不良情况。为了避免这种情况的发生，夫妻双方在怀孕前必须进行身体检查和遗传咨询，年龄较大的夫妻在准备怀孕前应进行染色体检查或采用第三代试管婴儿辅助生殖技术，以保证顺利怀孕和胎儿健康成长。
易导致胎儿畸形的不良因素主要有五个。
1、体温升高。发热是常见的致畸因素，发热越高，持续时间越长，致畸性越强；因此，准备怀孕的妇女和孕早期一定要注意防寒保暖，避免与发热病人接触，少去空气不洁、人群密集的公共场所等，尽量避免发热性疾病。发热的致畸性往往超过了疾病的来源。例如，细菌感染，细菌可能不会引起畸形，但发热可以引起畸形。一旦出现发烧，应立即去医院进行早期降温治疗。其他引起体温升高的问题，如高温作业、桑拿、热水浴等，不适合准备怀孕的男性和怀孕初期的女性。
2. 吸烟和酗酒。吸烟或被动吸烟会影响胎儿的发育，长期吸烟会造成婴儿早产、发育迟缓或先天性呆傻等不良问题；酒精被各国生殖医学专家认定为致畸物。酗酒的丈夫精子质量可能受到影响，妇女饮酒对胎儿的致畸率极高，酒精综合征的孩子容易出现多发性畸形、发育迟缓和智力低下等不良情况；因此，在备孕期间，孕妈咪首先要做的就是戒烟戒酒。
3. 拖延你的生育计划。昆明生殖医学中心的专家强调，女性的最佳生育期只有6-7年，23-30岁的女性在身体机能、卵巢功能、卵子质量等方面都是最有成效的；如果夫妻打算生孩子，一定要尽早制定生育计划，不能随大流，盲目怀孕。年龄越大，出现畸形儿或不良情况的几率越高，因为随着年龄的增长，夫妻双方自身的基因质量会下降和变异，质量不好的基因很容易造成胚胎的正常生长发育，造成畸形儿等不良情况。因此，受孕前要做好预防措施，对于受孕困难者要尽早备孕。
4. 盲目节育。早期流产有时是胎儿发育不良的初期表现，所以不能盲目保胎，要检查异常的原因；如果以母亲的因素为主，常见的有染色体异常、子宫有肌瘤或子宫畸形、内分泌失调等因素；如果发现有染色体等遗传畸变，就不要保胎，以免保住畸形儿。
5、接触有毒有害于胎儿的物质。孕妇在工作或生活中应注意尽量避免接触有毒有害的物质。例如，放射性物质、农药、铅、m